MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Eubacterium cylindroides T2-87 draft genome

Total Repeats: 23693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021019	TTC	2	6	12	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479169110
2	NC_021019	T	6	6	27	32	0 %	100 %	0 %	0 %	479169110
3	NC_021019	CAA	2	6	102	107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479169110
4	NC_021019	GCT	2	6	139	144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479169110
5	NC_021019	AT	3	6	154	159	50 %	50 %	0 %	0 %	479169110
6	NC_021019	ATC	2	6	195	200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479169110
7	NC_021019	CTT	2	6	353	358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479169110
8	NC_021019	ATA	2	6	370	375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479169110
9	NC_021019	TTGTT	2	10	618	627	0 %	80 %	20 %	0 %	479169110
10	NC_021019	TCT	2	6	678	683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479169111
11	NC_021019	TTTTC	2	10	685	694	0 %	80 %	0 %	20 %	479169111
12	NC_021019	CAT	2	6	710	715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479169111
13	NC_021019	AAG	2	6	750	755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479169111
14	NC_021019	CTG	2	6	785	790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479169111
15	NC_021019	TCTT	2	8	822	829	0 %	75 %	0 %	25 %	479169111
16	NC_021019	TTC	2	6	845	850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479169111
17	NC_021019	TGGT	2	8	883	890	0 %	50 %	50 %	0 %	479169111
18	NC_021019	CATC	2	8	892	899	25 %	25 %	0 %	50 %	479169111
19	NC_021019	AAT	2	6	900	905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479169111
20	NC_021019	GCT	3	9	946	954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479169111
21	NC_021019	ACC	2	6	956	961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479169111
22	NC_021019	TGC	2	6	1013	1018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479169111
23	NC_021019	T	6	6	1058	1063	0 %	100 %	0 %	0 %	479169111
24	NC_021019	TGT	2	6	1195	1200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479169111
25	NC_021019	TAA	2	6	1202	1207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479169111
26	NC_021019	CAA	2	6	1234	1239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479169111
27	NC_021019	TCAT	2	8	1242	1249	25 %	50 %	0 %	25 %	479169111
28	NC_021019	TTGA	2	8	1254	1261	25 %	50 %	25 %	0 %	479169111
29	NC_021019	AAT	2	6	1266	1271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479169111
30	NC_021019	ATTTT	2	10	1311	1320	20 %	80 %	0 %	0 %	479169111
31	NC_021019	ATAAA	2	10	1364	1373	80 %	20 %	0 %	0 %	479169111
32	NC_021019	T	6	6	1428	1433	0 %	100 %	0 %	0 %	479169112
33	NC_021019	AGA	2	6	1442	1447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479169112
34	NC_021019	ATA	2	6	1458	1463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479169112
35	NC_021019	AAT	2	6	1476	1481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479169112
36	NC_021019	TAC	2	6	1555	1560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479169112
37	NC_021019	AGC	2	6	1616	1621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479169112
38	NC_021019	CAA	2	6	1630	1635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479169112
39	NC_021019	TAGG	2	8	1684	1691	25 %	25 %	50 %	0 %	479169112
40	NC_021019	CTA	2	6	1765	1770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479169112
41	NC_021019	GAA	2	6	1801	1806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479169112
42	NC_021019	TAA	2	6	1861	1866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479169112
43	NC_021019	TTCT	2	8	3836	3843	0 %	75 %	0 %	25 %	479169113
44	NC_021019	TCA	2	6	3943	3948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479169113
45	NC_021019	ACA	2	6	4011	4016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479169113
46	NC_021019	CTT	2	6	4018	4023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479169113
47	NC_021019	AT	3	6	4099	4104	50 %	50 %	0 %	0 %	479169113
48	NC_021019	AGC	2	6	4115	4120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479169113
49	NC_021019	TCG	2	6	4201	4206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479169113
50	NC_021019	A	6	6	4221	4226	100 %	0 %	0 %	0 %	479169113
51	NC_021019	CATA	2	8	4242	4249	50 %	25 %	0 %	25 %	479169113
52	NC_021019	CAA	2	6	4298	4303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479169113
53	NC_021019	TCT	2	6	4317	4322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479169113
54	NC_021019	TGC	2	6	4391	4396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479169113
55	NC_021019	AT	3	6	4437	4442	50 %	50 %	0 %	0 %	479169113
56	NC_021019	T	6	6	4502	4507	0 %	100 %	0 %	0 %	479169113
57	NC_021019	TCAT	2	8	4611	4618	25 %	50 %	0 %	25 %	479169113
58	NC_021019	AT	3	6	4638	4643	50 %	50 %	0 %	0 %	479169113
59	NC_021019	A	6	6	4656	4661	100 %	0 %	0 %	0 %	479169114
60	NC_021019	GAT	3	9	4679	4687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479169114
61	NC_021019	ACC	2	6	4717	4722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479169114
62	NC_021019	ATCAA	2	10	4739	4748	60 %	20 %	0 %	20 %	479169114
63	NC_021019	TCCAA	2	10	4775	4784	40 %	20 %	0 %	40 %	479169114
64	NC_021019	CAAT	2	8	4805	4812	50 %	25 %	0 %	25 %	479169114
65	NC_021019	A	7	7	4886	4892	100 %	0 %	0 %	0 %	479169114
66	NC_021019	TTC	2	6	4945	4950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479169114
67	NC_021019	T	7	7	4957	4963	0 %	100 %	0 %	0 %	479169114
68	NC_021019	TAA	2	6	4966	4971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479169114
69	NC_021019	CAA	2	6	4981	4986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479169114
70	NC_021019	AATCAA	2	12	5040	5051	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479169114
71	NC_021019	TTCT	2	8	5146	5153	0 %	75 %	0 %	25 %	479169114
72	NC_021019	TCA	2	6	5216	5221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479169114
73	NC_021019	TGT	2	6	5254	5259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479169114
74	NC_021019	TGA	2	6	5279	5284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479169114
75	NC_021019	TCTT	2	8	5319	5326	0 %	75 %	0 %	25 %	479169114
76	NC_021019	T	6	6	5394	5399	0 %	100 %	0 %	0 %	479169114
77	NC_021019	CAT	2	6	5410	5415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479169114
78	NC_021019	TAA	2	6	5449	5454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479169114
79	NC_021019	CTT	2	6	5474	5479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479169114
80	NC_021019	ACA	2	6	5498	5503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479169114
81	NC_021019	ATG	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479169114
82	NC_021019	TAAA	2	8	5703	5710	75 %	25 %	0 %	0 %	479169114
83	NC_021019	ACC	2	6	5770	5775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479169115
84	NC_021019	ATTTCT	2	12	5863	5874	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479169115
85	NC_021019	TCT	2	6	5904	5909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479169115
86	NC_021019	T	6	6	7607	7612	0 %	100 %	0 %	0 %	479169116
87	NC_021019	CTTT	2	8	7617	7624	0 %	75 %	0 %	25 %	479169116
88	NC_021019	T	6	6	7634	7639	0 %	100 %	0 %	0 %	479169116
89	NC_021019	TAT	2	6	7705	7710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479169116
90	NC_021019	TATT	2	8	7725	7732	25 %	75 %	0 %	0 %	479169116
91	NC_021019	CGATA	2	10	7748	7757	40 %	20 %	20 %	20 %	479169116
92	NC_021019	ACC	2	6	7778	7783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479169116
93	NC_021019	TCT	2	6	7824	7829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479169116
94	NC_021019	CAT	2	6	7843	7848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479169116
95	NC_021019	ATC	2	6	7862	7867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479169116
96	NC_021019	AT	3	6	7887	7892	50 %	50 %	0 %	0 %	479169116
97	NC_021019	ATG	2	6	7920	7925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479169116
98	NC_021019	TAA	2	6	7952	7957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479169116
99	NC_021019	TAA	2	6	7987	7992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479169116
100	NC_021019	CTT	2	6	8032	8037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479169116
101	NC_021019	ACA	2	6	8061	8066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479169116
102	NC_021019	ACA	2	6	8110	8115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479169116
103	NC_021019	TCT	2	6	8277	8282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479169116
104	NC_021019	TCT	2	6	8352	8357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479169116
105	NC_021019	AT	3	6	8403	8408	50 %	50 %	0 %	0 %	479169116
106	NC_021019	AAT	2	6	8432	8437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479169116
107	NC_021019	CAA	2	6	8462	8467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479169116
108	NC_021019	TC	3	6	8520	8525	0 %	50 %	0 %	50 %	479169116
109	NC_021019	ATA	3	9	8597	8605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479169116
110	NC_021019	T	6	6	8653	8658	0 %	100 %	0 %	0 %	479169116
111	NC_021019	A	6	6	8682	8687	100 %	0 %	0 %	0 %	479169116
112	NC_021019	TAT	3	9	8713	8721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479169116
113	NC_021019	TCA	2	6	8802	8807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479169116
114	NC_021019	ATG	2	6	8829	8834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479169116
115	NC_021019	GTT	2	6	8845	8850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479169116
116	NC_021019	AGAA	2	8	8906	8913	75 %	0 %	25 %	0 %	479169116
117	NC_021019	AGA	2	6	8920	8925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479169116
118	NC_021019	GCG	2	6	8928	8933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479169116
119	NC_021019	CTG	2	6	8969	8974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479169116
120	NC_021019	TCCTA	2	10	9019	9028	20 %	40 %	0 %	40 %	479169117
121	NC_021019	ACG	2	6	9087	9092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479169117
122	NC_021019	ATC	2	6	9099	9104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479169117
123	NC_021019	AAC	2	6	9105	9110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479169117
124	NC_021019	GA	3	6	9164	9169	50 %	0 %	50 %	0 %	479169117
125	NC_021019	CAT	2	6	9195	9200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479169117
126	NC_021019	TAA	2	6	9201	9206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479169117
127	NC_021019	GTC	2	6	9220	9225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479169117
128	NC_021019	ATT	2	6	9237	9242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479169117
129	NC_021019	ATA	2	6	9246	9251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479169117
130	NC_021019	TCTT	2	8	9254	9261	0 %	75 %	0 %	25 %	479169117
131	NC_021019	TTC	2	6	9264	9269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479169117
132	NC_021019	TTA	2	6	9301	9306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479169117
133	NC_021019	TAA	2	6	9326	9331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479169117
134	NC_021019	ATC	2	6	9384	9389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479169117
135	NC_021019	CAT	3	9	9542	9550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479169117
136	NC_021019	CTT	2	6	9569	9574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479169117
137	NC_021019	CTT	2	6	9605	9610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479169117
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385	NC_021019	GAT	2	6	29982	29987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479169134
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387	NC_021019	AACC	2	8	30014	30021	50 %	0 %	0 %	50 %	479169134
388	NC_021019	A	6	6	30079	30084	100 %	0 %	0 %	0 %	479169134
389	NC_021019	TATG	2	8	30085	30092	25 %	50 %	25 %	0 %	479169134
390	NC_021019	ATAG	2	8	30095	30102	50 %	25 %	25 %	0 %	479169134
391	NC_021019	T	7	7	30299	30305	0 %	100 %	0 %	0 %	479169135
392	NC_021019	AG	3	6	30320	30325	50 %	0 %	50 %	0 %	479169135
393	NC_021019	T	6	6	30342	30347	0 %	100 %	0 %	0 %	479169135
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395	NC_021019	TGG	2	6	30383	30388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479169135
396	NC_021019	CG	3	6	30420	30425	0 %	0 %	50 %	50 %	479169135
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399	NC_021019	AAT	2	6	30588	30593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479169135
400	NC_021019	TTG	2	6	30679	30684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479169135
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404	NC_021019	TCTAT	2	10	30759	30768	20 %	60 %	0 %	20 %	479169135
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